iPhone 5s không phải là chiếc smartphone đầu tiên có cảm biến nhận diện vân tay: cảm ứng nhận diện vân tay đã từng xuất hiện trên Motorola Atrix từ năm ngoái và cũng đã xuất hiện trên một số mẫu smartphone 2013 như Pantech Vega LTE-A và cũng có thể xuất hiện trên cả HTC One Max sắp ra mắt.
Thành công của Apple là ở chỗ Quả táo đã biết tích hợp ,thay màn hình cảm biến vân tay một cách hoàn hảo vào trải nghiệm sử dụng iPhone 5s: do được tích hợp trên nút Home,thay màn hình iPhone 5S cảm biến vân tay của iPhone 5s không gây thêm bất kì phiền phức nào cho người dùng. Touch ID hoạt động tốt tới mức chỉ cần chạm nhẹ, có thể nhận diện từ nhiều góc độ và có tần suất nhận diện không chính xác thấp hơn các mẫu laptop doanh nhân. Các biên tập viên của CNET thậm chí còn thử nghiệm thành công nhận diện dấu vân... chân trên iPhone 5s.


Thiếu sót lớn của Touch ID là tính năng này chỉ hoạt động khi bạn mở khóa điện thoại và khi mua nội dung trên App Store hoặc iTunes. Touch ID không thể ghi nhớ các loại mật mã trên các ứng dụng khác, thay mặt kính và cũng không thể sử dụng để thanh toán trên các dịch vụ không thuộc về Apple.
Ngoài ra, nếu có sử dụng mật khẩu (passcode) thay mặt kính iPhone 6 thì bạn vẫn sẽ phải nhớ passcode của mình. Khi iPhone 5s được khởi động lại, hoặc sau 48 giờ không sử dụng, iPhone 6 bạn sẽ phải nhập lại passcode. Đây là một hình thức bảo vệ 2 lớp rất chắc chắn nhưng cũng khá bất tiện của Apple.

Sau 3 lần nhận diện vân tay không thành công, iPhone 5s sẽ cho phép bạn nhập passcode, và sau 5 lần nhận diện vân tay, bạn sẽ bắt buộc phải nhập passcode. Tương tự như các model iPhone cũ, sau 10 lần nhập passcode không thành công, iPhone 5s sẽ tự động xóa hết dữ liệu nếu bạn bật cài đặt này.
Trong tương lai, có thể Touch ID sẽ được sử dụng để tạo ra một thay mặt kính chiếc ví điện tử hoàn hảo, cho phép bạn chi trả trực tuyến hoặc lưu trữ vé xem phim, vé tàu xe... Hiện tại, thay mặt kính iPhone 6 Plus dữ liệu Touch ID và dấu vân tay của bạn sẽ được giữ (và mã hóa) trên vi xử lý A7 và iPhone 5s, nằm ngoài tầm iPhone 6 Plus kiểm soát của các dịch vụ trực tuyến và các ứng dụng của bên thứ 3. Tùy chọn này là khá tốt cho mục đích bảo mật, nhưng rất tiếc Touch ID chưa thể trở thành người thay thế hoàn hảo cho mật khẩu và các loại thẻ tín dụng.